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Utilisation des thermocycleurs pour l’identification des bactéries

Les bactéries sont des micro-organismes unicellulaires, c’est-à-dire des êtres vivants qui ne possèdent qu’une cellule. Leur taille est minuscule, ils mesurent généralement environ 0,5 et 5 ‰ de long et sont présents partout dans le monde, du sol à la croûte terrestre, en passant par la mer et même les déchets radioactifs, certains vivant également dans le corps humain sans causer de dommages.

La grande majorité des bactéries ne sont pas nocives, en fait, elles sont utiles, par exemple, elles peuvent détruire les cellules responsables de la maladie, digérer la nourriture, donner des vitamines au corps et même servir à préparer des aliments comme le fromage et le yaourt. Cependant, les bactéries infectieuses sont nocives pour l’organisme parce qu’elles causent des maladies, car elles répandent des toxines qui endommagent les tissus. Certaines maladies infectieuses dues aux bactéries sont la salmonellose, les infections à Escherichia coli ou le botulisme.

Pour la détection et le diagnostic des maladies bactériennes, les tests de culture bactérienne et le test de réaction en chaîne par polymérase (PCR) peuvent être appliqués à l’aide d’un échantillon d’urine, de sang, de peau ou de tout autre tissu. Grâce à la PCR et à l’aide d’un équipement appelé thermocycleur, l’ADN de champignons et de bactéries infectieuses est détecté.

Étapes d’un processus PCR

Le processus de réaction en chaîne par polymérase (PCR) est réalisé à l’aide d’un dispositif appelé thermocycleur, qui chauffe et refroidit des tubes de réaction pour le contrôle de la température appropriée à chaque phase de la réaction. Les étapes impliquées dans le processus de PCR sont divisées en étapes fondamentales suivantes:

  • La dénaturation de l’ADN, à ce stade, la chaîne d’ADN est séparée. Il faut une température de 94 à 95 °C.
  • L’alignement ou la liaison de l’amorce, où l’amorce se fixe à sa séquence complémentaire dans l’ADN moule.  Il faut abaisser la température entre 40° C et 68° C pendant environ 20 à 40 secondes.
  • L’extension ou l’allongement de la chaîne, où la polymérase agit et prend l’ADN moule pour synthétiser la chaîne complémentaire.

Thermocycleurs pour l’identification des bactéries

Un thermocycleur, est un dispositif très utile pour la biologie moléculaire, avec ce sont des cycles de température pour l’amplification de l’ADN dans le test de réaction en chaîne de la polymérase. Ce test est une réaction qui est effectuée dans un tube où sont contenus les composants nécessaires mélangés pour ensuite être incubés dans un thermocycleur, équipement qui laisse la température varier, pour que la dénaturation, l’hybridation et l’extension d’une molécule d’ADN aient lieu.

Parmi les différents domaines d’application de la PCR figurent les tests de paternité, la génétique, l’archéologie, la recherche biologique, la médecine légale et le diagnostic clinique. Dans le diagnostic médical, il est très utile, car à travers cela il est possible de détecter des virus, comme celui du sida, et des bactéries comme la Salmonella ou l’Escherichia coli, tous deux nocifs pour le corps humain.

Thermocycleurs

Le thermocycleur est un appareil très utile au sein des laboratoires, en particulier dans le domaine de la santé et de la recherche biologique, car il permet d’effectuer des cycles de températures nécessaires à l’amplification de différents brins d’ADN grâce à la technique de réaction en chaîne de la polymérase ou PCR.

Un thermocycleur classique est constitué d’un bloc de résistance électrique qui, à l’aide d’une plaque, permet d’augmenter la température et de rester homogène pendant les cycles où le test de réaction en chaîne de polymérase est effectué. Cet appareil est programmable et fonctionne généralement avec des températures allant de 4 °C à 96 °C.

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